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川农聚集中科院团队在水稻参谋中取得紧要残害

四川新闻网成皆5月29日讯（张喆 记者 陈淋）5月28日，天下顶尖学术期刊Cell在线发布了四川农业大学国度重心施行室、水稻参谋所李仕贵与钦鹏锻真金不怕火团队聚集中科院遗传与发育生物学参谋所梁承志参谋员团队完成的题为“Pan-genome analysis based on 33 high-quality assemblies provides insights into hidden genomic variations in rice”（基于33个水稻遗传各种性材料的泛基因组分析揭示“荫藏”的基因组变异）的参谋论文，被Cell审稿东说念主评价为“泛基因组学参谋的经典之作”。

这是四川农大继陈学伟锻真金不怕火团队之后，再次在Cell上发表论文，亦然该校第3篇CNS（Cell Nature Science）顶级学术期刊论文。

团队选取了具有高度代表性的33个水稻材料，经受最新的第三代基因测序技艺，对其中31份材料进行了长片断测序、高质地基因组拼装及基因留神。联结已报说念的日本晴和蜀恢498两个材料的参考基因组，共毅力到171,072个基因结构性变异和22,549个基因拷贝数变异。这些基因组变异无法利用传统妙技毅力到，绝大大宗在先前参谋中均未发现，但在迫切农艺性状调控中施展迫切作用。举例，着名日本优质稻品种“越光”中一个早熟位点（qDTH7-3），可能由OsMADS18基因在“越光”产生两个拷贝，导致抒发量升高从而推崇早熟表型。揭示这些结构性变异的标的对意会水稻的进化和驯化遗传基础也有迫切兴趣兴趣。

举例有参谋以为，籼稻群体中两个与植物激素“独脚金内酯”合成关联基因SLB1和SLB2的缺失是被东说念主工采取到的。但这次参谋分析，发现很可能是粳稻中取得SLB1和SLB2基因序列，或因其能匡助磷的继承提高产量而被保留住来。参谋东说念主员还初次构建了水稻图形基因组，是水稻中迄今最为完备的基于图形结构的泛基因组。

李仕贵锻真金不怕火暗示，此参谋通过翻开结构性变异参谋的大门，鼓励水稻高质地泛基因组参谋，将为参谋水稻等作物进化与驯化、基因组参谋、种质资源的精确评价、优良基因的挖掘、基因功能涌现等参谋奠定坚实基础，有助于进步了水稻功能基因组学和分子策画育种参谋水平，为选育高产优质、绿色安全水稻新品种提供基础支合手。他暗示，接下来团队就将把参谋恶果专揽到应用基础参谋和育种使命中，力求汲引出更多产量高、品性好、抗性强的水稻品种，效用破解“卡脖子”艰苦，持久把中国东说念主的饭碗紧紧端在我方手中。

（图片来自四川农业大学）

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